一是落實黨中央決策部署不堅決不徹底。甘肅省委和省政府沒有站在政治和全局的高度深刻認識祁連山生態(tài)環(huán)境保護的極端重要性，在工作中沒有做到真抓真管、一抓到底。2016年5月，甘肅省曾經(jīng)組織對祁連山生態(tài)環(huán)境問題整治情況開展督查，但未查處典型違法違規(guī)項目，形成督查報告后就不了了之。甘肅有關省直部門和市縣在貫徹落實黨中央決策部署上作選擇、搞變通、打折扣，省安全監(jiān)管局在省政府明確將位于保護區(qū)的馬營溝煤礦下泉溝礦井列入關閉退出名單的情況下，仍然批復核定生產(chǎn)能力并同意復工。張掖市委認為祁連山生態(tài)環(huán)境保護整改落實工作不屬于市委常委會研究的重大問題，市委常委會沒有進行專題研究部署，并在明知有的項目位于保護區(qū)、違反保護區(qū)管理要求的情況下，仍多次要求有關縣加快辦理項目手續(xù)。

二是在立法層面為破壞生態(tài)行為“放水”。甘肅省有關方面對“五位一體”總體布局和新發(fā)展理念認識不深刻，片面追求經(jīng)濟增長和顯績，長期存在生態(tài)環(huán)境為經(jīng)濟發(fā)展讓路的情況。《甘肅祁連山國家級自然保護區(qū)管理條例》歷經(jīng)三次修正，部分規(guī)定始終與《中華人民共和國自然保護區(qū)條例》不一致，將國家規(guī)定“禁止在自然保護區(qū)內(nèi)進行砍伐、放牧、狩獵、捕撈、采藥、開墾、燒荒、開礦、采石、挖沙”等10類活動，縮減為“禁止進行狩獵、墾荒、燒荒”等3類活動，而這3類都是近年來發(fā)生頻次少、基本已得到控制的事項，其他7類恰恰是近年來頻繁發(fā)生且對生態(tài)環(huán)境破壞明顯的事項。2013年5月修訂的《甘肅省礦產(chǎn)資源勘查開采審批管理辦法》，違法允許在國家級自然保護區(qū)實驗區(qū)進行礦產(chǎn)開采?！陡拭C省煤炭行業(yè)化解過剩產(chǎn)能實現(xiàn)脫困發(fā)展實施方案》違規(guī)將保護區(qū)內(nèi)11處煤礦予以保留。張掖市在設定全市黨政領導干部績效考核時，把2015年和2016年環(huán)境資源類指標分值分別設為9分和8分，低于2013年和2014年11分的水平。

三是不作為、亂作為，監(jiān)管層層失守。在祁連山生態(tài)環(huán)境保護方面，甘肅省從主管部門到保護區(qū)管理部門，從綜合管理部門到具體審批單位，責任不落實、履職不到位問題比較突出，以致一些違法違規(guī)項目暢通無阻，自然保護區(qū)管理有關規(guī)定名存實亡。省國土資源廳在2014年10月國務院批復甘肅祁連山國家級自然保護區(qū)劃界后，仍違法違規(guī)延續(xù)、變更或?qū)徟?4宗礦權，性質(zhì)惡劣。省發(fā)展改革委在項目核準和驗收工作中，以國土、環(huán)保、林業(yè)等部門前置審批作為“擋箭牌”，違法違規(guī)核準、驗收保護區(qū)內(nèi)非法建設項目。省環(huán)境保護廳不僅沒有加強對有關部門工作的指導、監(jiān)督，反而在保護區(qū)劃界確定后仍違法違規(guī)審批或驗收項目。省政府法制辦等部門在修正《甘肅祁連山國家級自然保護區(qū)管理條例》過程中，明知相關規(guī)定不符合中央要求和國家法律，但沒有從嚴把關，致使該條例一路綠燈予以通過。

四是不擔當、不碰硬，整改落實不力。在祁連山生態(tài)環(huán)境問題整改落實中，普遍存在以文件落實整改、以會議推進工作、以批示代替檢查的情況，發(fā)現(xiàn)問題不去抓、不去處理，或者抓了一下追責也不到位，不敢較真碰硬、怕得罪人，甚至弄虛作假、包庇縱容。從2013年至2016年，甘肅省對祁連山生態(tài)環(huán)境保護不作為、亂作為問題基本沒有問過責。承擔整改任務較重的林業(yè)、國土、環(huán)保、水利等部門雖然開了會議、發(fā)了文件，但抓落實不夠。省林業(yè)廳及甘肅祁連山國家級自然保護區(qū)管理局不僅對保護區(qū)內(nèi)大量違法違規(guī)建設項目監(jiān)督不力，對大量生態(tài)破壞行為查處不力，反而違規(guī)許可多個建設項目。張掖市在約談整改中避重就輕，有31個生態(tài)破壞項目沒有納入排查整治范圍；52個違法違規(guī)探礦項目中有31個采取簡單凍結辦法，沒有制定有效退出機制和保障措施。

為嚴肅法紀，根據(jù)《中國共產(chǎn)黨問責條例》《中國共產(chǎn)黨紀律處分條例》《黨政領導干部生態(tài)環(huán)境損害責任追究辦法（試行）》等有關規(guī)定，按照黨政同責、一崗雙責、終身追責、權責一致的原則，經(jīng)黨中央批準，決定對相關責任單位和責任人進行嚴肅問責。